Les différents postes-frontières que l’on trouve le long de la Meuse ont constitué des points de discussion lors de la création de la Belgique en 1830.
La ville fortifiée de Stokkem a reçu le droit de cité en 1244 en tant que partie du comté de Looz. Avant la grande vague de fusions des communes, Elen, Rotem, Stokkem, Dilsen et Lanklaar avaient déjà fusionné avec la commune de Dilsen en 1971.
Le nom « Stokkem » a été ajouté en 1987. Le titre de « ville » s’explique par le droit de cité
jadis accordé à Stokkem dans le comté de Looz.